每周例题-遗传图谱--生物奥赛

50．以下哪些是作基因组的高密度连锁图所必需 的(多选) A.SSR B.FISH C.STS D.SNP E.DNA指纹图谱

这周为大家分享的是有关于人类基因组计划中，遗传图谱的绘制，接下来还会为大家分享有关于物理图谱、序列图谱等的相关知识，希望大家能够掌握。

首先，什么是高密度连锁图？就是基因组的遗传图谱。 遗传图谱

又称连锁图谱（linkage map），它是以具有遗传多态性（在一个遗传位点上具有一个以上的等位基因，在群体中的出现频率皆高于1%）的遗传标记为“路标”，以遗传学距离（在减数分裂事件中两个位点之间进行交换、重组的百分率，1%的重组率称为1cM）为图距的基因组图。

相信大家都还记得摩尔根的连锁互换定律，遗传图谱就是运用了这样的方法，先选定遗传学标记（一些多态性的小片段，你可以把它当做一对等位基因来考虑）之后测定后代中交换类型配子占总配子的比例，来确定这些多态性片段之间的遗传学距离，经过计算机整合，绘制出这个基因组中，各片段标记之间的距离。

首先确定的前提是，基因是有多态性的。什么是多态性？

多态性是指在一个生物群体中，同时和经常存在两种或多种不连续的变异型或基因型（genotype）或等位基因（allele），亦称遗传多态性（genetic polymorphism）或基因多态性。从本质上来讲，多态性的产生在于基因水平上的变异，一般发生在基因序列中不编码蛋白的区域和没有重要调节功能的区域。生物群体基因多态性现象十分普遍，其中，人类基因的结构、表达和功能，研究比较深入。人类基因多态性既来源于基因组中重复序列拷贝

数的不同，也来源于单拷贝序列的变异，以及双等位基因的转换或替换。按引起关注和研究的先后，通常分为3大类：DNA片段长度多态性、DNA重复序列多态性、单核苷酸多态性。

 DNA片段长度多态性（FLP），即由于单个碱基的缺失、重复和插入所引起限制性

内切酶位点的变化，而导致DNA片段长度的变化。又称限制性片段长度多态性，这是一类比较普遍的多态性。

 DNA重复序列的多态性（RSP），特别是短串联重复序列，如小卫星DNA和微卫

星DNA，主要表现于重复序列拷贝数的变异。小卫星（minisatellite）DNA由15~65bp的基本单位串联而成，总长通常不超过20kb，重复次数在人群中是高度变异的。这种可变数目串联重复序列（VNTR）决定了小卫星DNA长度的多态性。微卫星（microsatellite）DNA的基本序列只有1~8bp，而且通常只重复10~60次。

 单核苷酸多态性（SNP），即散在的单个碱基的不同，基因组中单核苷酸的缺失,

插入与重复序列不属於SNP，但更多的是单个碱基的置换， SNP大多数为转换，作为一种碱基的替换，在基因组中数量巨大，分布频密，而且其检测易于自动化和批量化，因而被认为是新一代的遗传标记。

作基因组的高密度连锁图时，主要应用的多态性 标记有以下三大类：

(1)限制性片段长度多态性(RFLP)：用限制性内 切酶切割DNA链，由于一些位置的点突变，造成能切和不能切两种状况，而产生不同长度的等位片段，可用凝胶电泳显示其多态性。

(2)DNA重复序列的多态性标记：包括小卫星 DNA重复序列或数目可变串联重复(VNTR)的多态性 (基因组DNA中数十到数百个核苷酸片段的重复)，和 微卫星DNA(SSR)

的多态性(基因组中由1—6个核苷 酸组成的基本单位重复多次构成的一段DNA，广泛分布于基因组的不同位置)。微卫星DNA(SSR)是目前 最有用的遗传标记。

(3)单核苷酸多态性标记(SNP)：SNP是指变异频率大于l％的单核苷酸变异。在人类基因组中大概每 l000个碱基就有一个SNP，人类基因组上的SNP总量 大概是300万个，这可能达到了人类基因组多态位点 数目的极限，因此被认为是应用前景最好的遗传标记。

这道题提到的其他三个技术是：

FISH（荧光原位杂交技术）：利用荧光标记的特异核酸探针与细胞内相应的靶DNA 分子或RNA分子杂交，通过在荧光显微镜或共聚焦激 光扫描仪下观察荧光信号，来确定与特异探针杂交后被染色的细胞或细胞器的形态和分布，或者是结合了荧光探针的DNA区域或RNA分子在染色体或其他细胞器中的定位。荧光原位杂交技术可以简单的确定基因顺序，但是所测两个片段间距要大于lMbp，因而不能用以完成高密度连锁图。

STS(序列标记位点):是对以特定引物进行PCR特异扩增的一类分子标记的统称。通过设计特定的引物，使其与基因组DNA序列中特定的位点结合，从而可用来扩增基因组中特定区域。该技术主要用于基因组物理图谱的构建。

DNA指纹图谱用小卫星DNA做探针，与人基因组酶切片段进行Southen杂交，在低严谨条件下杂交产生由10多条带组成的杂交图谱。不同个体杂交图谱上带的位置是千差万别的，就像人的指纹一样因人而异，因而被称之为DNA指纹图谱，是一种相对简陋的基因图谱，主要用于司法鉴定、亲子鉴定。

希望大家能够掌握，今后遇见相关题目不失分。